顔は鼻筋が通り、耳の毛は短い。
全身の毛はそれほど長くない。
尾は細長いものと極端に短いものがあるが、細長くても先だけが折れ曲がっているものもいます。
尾の短いものは尾骨が複雑に折れ曲がっていることが多いが、毛に覆われているために、外見上は単純な切り株状に見えます。
短尾のネコは、世界的には比較的珍しく、日本猫の特徴の1つとなっている。一説に、尾は東へ行くほど細長く、関西では短く、西へ行くと折れ曲がっているらしい。
毛並みの美しさには定評があるが、またその色分けも外国人から珍しがられています。
白・黒の一色、濃淡帯状の縞模様、白地に黒ぶちや茶ぶち、そして三毛猫と呼ばれる白・茶・黒の三色に色分けされているものなどがいます。
縞模様のネコはトラネコと呼ばれ、茶縞のものをチャトラ、こげ茶縞のものをキジトラ、灰色縞のものをサバトラと特に分けて呼ぶ場合もあります。
毛の色は遺伝的要素や母体内での影響などが考えられているが、隔世遺伝なども起こるためか、必ずしも両親と同じ色が生まれるわけでもありません。
伴性遺伝の関係で、白い面積の多いネコはメスが多く白以外の色のネコはオスが多い。また三毛猫はほぼ全てがメスです。
その祖先は、元々日本に棲息していた野性猫がイエネコ化したわけではなく、遠くエジプトで飼いならされた猫がインド（前３世紀頃？）ー中国（５世紀頃？）へと広がり、仏教伝来（６世紀〜）とともに経典をネズミから守るために船に乗せられて日本に渡った猫が現在の日本猫の祖先だというのが最も一般的な説です。
しかし、日本猫として確立された時期については確かな事は分からないようです。
日本猫を原種としてアメリカで改良され固定された品種が『ジャパニーズ・ボブテイル』です。当然スタンダードがありますが、原種となった日本猫は元々協会認定の品種猫ではありませんからスタンダードはありませんでした。
